德國水協(xié)DWA指導(dǎo)污水處理系統(tǒng)抗擊新冠病毒 講規(guī)矩?。ㄋ模?

2023-11-01

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追蹤病毒行進(jìn)的路線,成為污水的守望者
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 導(dǎo)讀
  為了服務(wù)更多水行業(yè)技術(shù)人員,《凈水技術(shù)》雜志社以我國一線水行業(yè)技術(shù)工作者對最新科研成果與動態(tài)的求知需求為出發(fā),針對最新科研成果與技術(shù),將最新SCI文章進(jìn)行翻譯整理,力求為廣大讀者提供幫助。
  編者按
  世界各地的研究小組都在研究城市污水監(jiān)測是否能被整合到SARS-CoV-2和其他病原體的監(jiān)測系統(tǒng)中。作者Charles Schmidt梳理了疫情發(fā)生以來世界各國污水監(jiān)測預(yù)警的情況,小編對本文進(jìn)行了翻譯,由于翻譯能力有限,譯文可能有誤,請以原文為準(zhǔn)。
  今年6月,美國各地對COVID-19解除封鎖后,該國一些地區(qū)新增病例數(shù)突然開始增加?,F(xiàn)在,休斯敦貝勒醫(yī)學(xué)院的微生物學(xué)家Anthony Maresso提供技術(shù)支持,休斯頓的衛(wèi)生官員正在該市龐大的下水道系統(tǒng)中追蹤這種疾病的病原體SARS-CoV-2。他們每周都要在38個地方進(jìn)行取樣,同時發(fā)現(xiàn)在城市中病毒傳播呈波狀流動的活動模式:一個地區(qū)確診病例可能減少,而它附近地區(qū)的確診病例開始上升?!?br>  來自世界各地的研究表明,SARS-CoV-2的遺傳痕跡與COVID-19疾病趨勢相關(guān)。一項研究報道稱從荷蘭的阿默斯福特收集的污水樣本,在該城市被診斷出COVID-19的六天前就呈陽性檢測,表明”廢水監(jiān)測可以作為SARS-CoV-2社區(qū)傳播的早期預(yù)警?!保⊿CI搬運工 | 污水流行病學(xué)(WBE)應(yīng)用于COVID-19的全球經(jīng)驗)
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  圖片來源:STANCA SANDA / Alamy Stock Photo,F(xiàn)red Mack / Alamy Stock Photo
  衛(wèi)生官員依賴于病人的臨床診斷來進(jìn)行檢測。這種方法忽略了未報告的病例,因此低估了實際發(fā)病率和未來的住院人數(shù)。水研究基金會的首席執(zhí)行官彼得·格雷瓦特(Peter Grevatt)表示,迄今為止的證據(jù)表明,廢水中的病毒信號與臨床病例的趨勢相關(guān),這使得當(dāng)時成為疾病流行的領(lǐng)先指標(biāo),并為COVID-19減少后可能再次出現(xiàn)的先兆。
  已知的未知數(shù)
  SARS-CoV-2在糞便和污水中仍具有傳染性的程度仍不確定。該病毒可在表達(dá)其結(jié)合位點的血管內(nèi)皮上皮細(xì)胞中高效復(fù)制-血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2受體。在2002年至2003年的SARS流行期間,在香港高層公寓的管道系統(tǒng)中被檢測到SARS冠狀病毒。據(jù)推測,某些感染可能是由于暴露于從浴室通風(fēng)口和開放的地漏向空氣中遷移的霧化病毒顆粒引起的。最近的一項研究表明,通過沖水的馬桶向上拋出的霧化SARS-CoV-2可以在空中的云中盤旋數(shù)分鐘,作者認(rèn)為廁所可以促進(jìn)病毒傳播??茖W(xué)家推測,新鮮糞便構(gòu)成最大的暴露風(fēng)險。同時也有專家表示,SARS-CoV-2可能無法在腸道細(xì)胞中正確復(fù)制,因此病毒后代可能無法感染其他人。此外,去污劑和pH值的變化可能會破壞病毒,因為它們在污水中傳播時,同時稀釋將其濃度降低至低于感染劑量的水平。
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  圖源:攝圖網(wǎng)
  污水監(jiān)測的歷史
  檢測污水中的病毒由來已久。在20世紀(jì)40年代,細(xì)胞培養(yǎng)方法被用于監(jiān)測污水中的脊髓灰質(zhì)炎和其他病毒病原體。在20世紀(jì)80年代采用了cDNA探針雜交技術(shù)來監(jiān)測甲型肝炎病毒,在90年代科學(xué)家開始轉(zhuǎn)向更敏感的聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)方法,這種方法至今仍在該領(lǐng)域廣泛使用。
  污水監(jiān)測項目
  世界各國目前正在啟動污水監(jiān)測項目,目的是預(yù)測疫情新爆發(fā),加強防備,并為開放學(xué)校、餐館和其他公共場所的計劃提供信息。例如,西班牙的科學(xué)家已經(jīng)宣布計劃每周對250個污水處理廠進(jìn)行兩次取樣。今年3月,以色列本古里安大學(xué)(Ben Gurion University)和衛(wèi)生部的研究人員開始對污水進(jìn)行常規(guī)取樣,以檢測SARS-CoV-2的蹤跡。在美國, BioBot Analytics公司正在代表全國400多家污水處理廠進(jìn)行樣品分析。
  美國疾病控制和預(yù)防中心(CDC)的環(huán)境微生物學(xué)家艾米·柯比(Amy Kirby)說:“污水監(jiān)測的科學(xué)仍在發(fā)展,但有證據(jù)表明,它可以成為一個特定社區(qū)流行趨勢的有用指標(biāo)?!盞irby補充說:“疾控中心目前正在評估污水監(jiān)測的效用,以提供可靠和可操作的應(yīng)對信息,并計劃建立一個全國住房監(jiān)測系統(tǒng),并解讀污水?dāng)?shù)據(jù),為應(yīng)對COVID-19提供信息?!?br>  現(xiàn)在還處于早期階段,Kirby表示,不應(yīng)僅將污水監(jiān)測用于做出公共衛(wèi)生決策,而應(yīng)“與流行病趨勢的其他臨床指標(biāo)相一致”。
  污水監(jiān)測發(fā)展協(xié)議
  目前,制定檢測未經(jīng)處理的污水中SARS-CoV-2的標(biāo)準(zhǔn)實驗室規(guī)程已成為該領(lǐng)域的優(yōu)先事項。6月,水研究基金會開始組建一個專家小組,負(fù)責(zé)評估現(xiàn)有的實驗室方法,并選擇產(chǎn)生最可靠結(jié)果的方法。他們需要更好地了解不同實驗室的方案,如何根據(jù)它們使用的PCR引物組以及濃縮和保存遺傳信號的方法進(jìn)行比較。
  污水樣本一般從流入污水處理廠的未經(jīng)處理的污水中采集,或在某些情況下從下水道、泵站或個別建筑物(如醫(yī)院)的管道系統(tǒng)中采集。有機(jī)物含量、工業(yè)廢料、腐殖酸、溫度、降雨、海水和其他變量可以抑制、延緩或改變病毒信號,而病毒信號在一天中不斷變化。基于這個原因,在多個小時內(nèi)采集的復(fù)合樣本比在單一時間點采集的樣本更具代表性。
  SARS-CoV-2病毒在污水中被高度稀釋,因此將其濃縮成較小的液體量對分析過程至關(guān)重要。有些實驗室使用靜電過濾器來濃縮病毒,帶負(fù)電荷的病毒會吸附到靜電過濾器上?;诔叽缗懦某瑸V是另一種選擇,如聚乙二醇沉淀。
  上述方法在環(huán)境病毒學(xué)中有著悠久的歷史,但它們是為諾如病毒、甲型肝炎病毒等無包膜腸道病毒而發(fā)展起來的。相比之下,SARS-CoV-2是一種包膜病毒,這意味著外部的脂膜保護(hù)著它的RNA基因組。風(fēng)險在于目前的方法過于苛刻,以至于病毒在濃縮過程中分解,其中一部分RNA在被檢測到之前就丟失了。
  用于病毒檢測的逆轉(zhuǎn)錄和PCR (RT-PCR)引物組也可能是這樣。目前,大多數(shù)實驗室都使用CDC為臨床診斷目的而選擇的引物——特別是針對SARS-CoV-2核衣殼蛋白1 (N1)和2 (N2)基因的引物,這兩個基因是病毒基因組的保守區(qū)域。根據(jù)Kirby的說法,N1和N2引物對SARS-CoV-2具有高度特異性。
  污水監(jiān)測與診斷結(jié)果呈平行的趨勢
  到目前為止,污水取樣結(jié)果和診斷趨勢之間的相關(guān)性看起來很強。對從事COVID-19污水監(jiān)測工作的人來說,最令人鼓舞的是,獨立小組的數(shù)量能夠證明臨床確診病例數(shù)量與相應(yīng)下水道中RNA信號強度之間高質(zhì)量相關(guān)性。
  漢普頓公路環(huán)衛(wèi)區(qū)(HRSD)已經(jīng)對污水中的腸道病原體進(jìn)行了多年的監(jiān)測, HRSD的化學(xué)家在3月初發(fā)現(xiàn)了SARS-CoV-2信號,當(dāng)時該地區(qū)只有兩例COVID-19確診病例。到目前為止,分析趨勢“似乎與弗吉尼亞州衛(wèi)生部提供的診斷信息相吻合?!彼a充道。此外,基因信號強度的趨勢因不同服務(wù)區(qū)的特征而不同,有些國家擁有更多的工業(yè)和醫(yī)院。
  由亞利桑那州坦佩市發(fā)起的污水監(jiān)測項目還顯示了污水中的病毒載量如何隨人口的性質(zhì)而變化,瓜達(dá)盧佩的COVID-19發(fā)病率比周圍的馬里科帕縣高出4倍以上。此外,瓜達(dá)盧佩的污水中的病毒載量一直在升高,盡管在市政府官員于4月和5月實施封鎖期間,坦佩較富裕地區(qū)的污水水平有所下降。
  BioBot的Matus將污水監(jiān)測描述為監(jiān)測高危地區(qū)的一種有效的“熱點定位工具”,并補充說,通過在街道或建筑層面采樣,科學(xué)家可以更細(xì)致地了解當(dāng)?shù)氐募膊≮厔?。取樣顯示,污水中的病毒濃度因社區(qū)的不同而不同,這取決于家庭的平均收入和獲得醫(yī)療保健的機(jī)會。有專家表示,如果想部署資源抗擊COVID-19,我們需要把重點放在服務(wù)不足的社區(qū)。
  污水監(jiān)測的數(shù)據(jù)
  Alm和Matus表示,他們的模型現(xiàn)在已經(jīng)超出了趨勢估計的范圍,無法推斷出特定地區(qū)的感染人數(shù)。6月23日,BioBot團(tuán)隊及其合作者在medRxiv發(fā)布了一份研究報告,該報告指出,馬薩諸塞州城市污水處理廠的病毒載量在服務(wù)總計225萬人飆升的診斷病例激增。該病毒在3月3日從該水廠的樣本中首次檢測到的,當(dāng)時服務(wù)區(qū)域中只有兩個人被診斷出患有COVID-19。四天后,新冠肺炎的臨床報告達(dá)到了相應(yīng)的高度,這符合從感染到癥狀出現(xiàn)的典型的4~5 d潛伏期。
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  通過將污水中的病毒滴度與經(jīng)過診斷的病例數(shù)進(jìn)行數(shù)學(xué)擬合,可以推斷出與感染數(shù)量相對應(yīng)的糞便排便率。在感染初期,脫落功能在患者出現(xiàn)癥狀和接受檢測之前就出現(xiàn)了一個巨大的峰值。在那之后,它就呈指數(shù)級下降?;蛐盘柕耐蝗辉鰪姺从臣膊〉陌l(fā)病率——實際上是未來將報告的新病例數(shù)量。
  然而,另一些專家則持懷疑態(tài)度,他們認(rèn)為,考慮到建模的不確定性,特別是在排污率方面,污水監(jiān)測目前更適合于對特定地區(qū)的疾病發(fā)病率是下降還是上升進(jìn)行更有限的評估。
  馬薩諸塞州公共衛(wèi)生部傳染病和實驗室科學(xué)局的醫(yī)學(xué)主任勞倫斯·馬多夫(Lawrence Madoff)說,污水監(jiān)測不能取代其他監(jiān)測方法,他認(rèn)為所有這些方法都是互補的。但他補充說,到目前為止,污水監(jiān)測的證據(jù)是令人鼓舞的和可操作的。這可以促使工作者通過觀察其他信號(如檢測或住院數(shù)據(jù)),來更仔細(xì)地觀察特定區(qū)域的情況。
  特拉華州紐卡斯?fàn)柕目h長馬修·邁耶(Matthew Meyer)表示,污水監(jiān)測已經(jīng)在他所管轄區(qū)(大約有56萬居民)的大流行應(yīng)對措施中提供了信息??h政府官員每周都要從該地區(qū)的11個污水處理分站獲取最新的采樣數(shù)據(jù),據(jù)邁耶(Meyer)說,其覆蓋范圍遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過了臨床測試的可行性。
  加州大學(xué)圣地亞哥分校的微生物學(xué)家羅布·奈特(Rob Knight)說,對COVID-19的污水監(jiān)測顯示出巨大的潛力。他的團(tuán)隊計劃監(jiān)測食堂、宿舍和其他校園建筑中的污水樣本,這是作為該?!爸胤敌@”計劃的一部分,該計劃還包括對SARS-CoV-2檢測呈陽性的學(xué)生進(jìn)行聯(lián)系追蹤和隔離居住。但奈特說,仍然需要從不同人群獲得更多數(shù)據(jù),特別是關(guān)于流失率以及其控制因素的數(shù)據(jù)。

  本文作者:Charles Schmidt Portland, ME, USA.